Molibden se večinoma uporablja v jeklarski industriji, večina tega je industrijski blok tlaka molibdenovega oksida, ki se neposredno uporablja v jeklu ali litem železu, majhen del taline v molibdenovo železovo molibdensko folijo, ki se kasneje uporablja pri izdelavi jekla.
Vsebnost molibdena v nizko legiranem jeklu ni večja od 1%, vendar poraba tega območja predstavlja približno 50% celotne porabe molibdena. Dodatek molibdena v nerjavno jeklo izboljša odpornost jekla proti koroziji. Molibden je dodan litemu železu za izboljšanje trdnosti železa in odpornosti proti obrabi. Superzlitina na osnovi niklja, ki vsebuje 18 % molibdena, ima visoko tališče, nizko gostoto in nizek koeficient toplotnega raztezanja, ki se uporablja za izdelavo različnih visokotemperaturnih delov v letalstvu in vesolju. Kovinski molibden se pogosto uporablja v elektronskih napravah, kot so cevi, tranzistorji in usmerniki. Molibdenov oksid in molibdat sta odlična katalizatorja v kemični in naftni industriji. Molibdenov disulfid je pomembno mazivo, ki se uporablja v letalski in strojni industriji. Molibden je eden od potrebnih elementov v sledovih rastlin, ki se uporablja v kmetijstvu kot gnojilo v sledovih.
Žica iz čistega molibdena za visokotemperaturno električno peč in obdelavo z električno iskro ter obdelavo z rezanjem žice; Molibdenove tablete za proizvodnjo radijske in rentgenske opreme; Molibden, odporen na visokotemperaturno ablacijo molibdenovega lončka, se večinoma uporablja pri izdelavi topniškega zaklepa, raketne odprtine, nosilca električne žarnice iz volframove žice. Dodatek molibdena v legirano jeklo lahko izboljša mejo elastičnosti, odpornost proti koroziji in trajni magnetizem. Molibden je eno od sedmih mikrohranil, potrebnih za rast in razvoj rastlin. Živali in ribe, tako kot rastline, prav tako potrebujejo molibden.
